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恒電位控制箱通過輔助陽極向要保護的水下金屬結構施加保護電流，并能過參比電極監測被保護的鋼結構相對于海水的電位差，使被保護的結構與海水間的電位差保持在設定的保護電位。岸上管理系統由計算機和信號接收裝置組成，可通過internet或無線網絡與安裝于各風電樁上的恒電位控制箱進行通訊，可設置各風電樁的保護電位，實時顯示各恒電位控制箱的輸出電壓、輸出電流、參比電位以及各報警信號，并實現所有數據的下載。
腐蝕的機理和陰極保護原理：
對于海上風電樁基來說，其腐蝕主要的就是樁基水下部分的電化學腐蝕：
金屬在海水中的船體腐蝕是一種電化學現象，該現象由船體金屬表面形成的眾多原電池所引起的。就像在電池所發生的一樣，腐蝕電流由金屬的更活躍部分（或稱作陽極）通過海水流向金屬的較不活躍部分（或稱作陰極）。該原電池不僅可在不同的金屬之間形成，也能在同一金屬的不同區域間形成。在這種情況之下，因噴涂因素形成的保護不夠的區域相對于較好保護的區域就變為了陽極。事實證明，金屬的腐蝕量與腐蝕電流的大小成正比。
鋼鐵在海水中的保護電位只能通過試驗來測定。實驗表明，A3鋼在海水中的自然腐蝕電位，相對于銀/氯化銀參比電極約為-0.6伏左右，而相對于鋅參比電極，則在+0.45V左右。當被保護對象的陰極電位極化至-0.80～-1.0伏（相對于銀/氯化銀參比電極），或+0.25～+0.15伏（相對于鋅參比電極）時，保護效率可達到94％～99％。
風電樁基的陰極保護就是基于電化學原理，通過施加外部電流，使受保護對象的電極電位朝負方向移動，從而降低腐蝕速率。根據保護電流的來源，陰極保護有外加（強制）電流陰極保護和犧牲陽極陰極保護兩種：
1、外加電流陰極保護是通過外加直流電源以及輔助陽極，是給金屬補充大量的電子，使被保護金屬整體處于電子過剩的狀態，使金屬表面各點達到同一負電位，使被保護金屬結構電位低于周圍環境。外加（強制）電流陰極保護是設一外部電源和輔助陽極，將外部電源、保護對象（風電樁基）和輔助陽極經海水構成回路，由外部電源提供保護電流，從而達到防腐蝕的效果，系統中，另設參比電極來檢測被保護對象相對于海水的電位，外部電源通過設定的保護電位與檢測到的參比電位進行比較，從而調節輸出的保護電流使系統達到的保護效果。
2、犧牲陽極陰極保護是將電位更負的金屬（較活潑的金屬，如鋅合金、鋁鎂合金等）與被保護金屬連接，并處于同一電解質中，使該金屬上的電子轉移到被保護金屬上去，使整個被保護金屬處于一個較負的相同的電位下，從而抑制后者的腐蝕。該方式簡便易行，不需要外加電源，很少產生腐蝕干擾。根據國內有關資料的報道，對于犧牲陽極的使用有很多失敗的教訓，認為犧牲陽極的使用壽命一般不會超過3年，最多5年。